1998, la ville de Raccoon City connaît une vague de violence sans précédent. Des corps horriblement mutilés sont retrouvés un peu partout dans la ville. Aux vues de l’ampleur de la violence et la méthode des meurtres, la police de Raccoon City appelle la Special Tactics and Rescue Service (S.T.A.R.S.) à enquêter.

À la recherche d’une piste, l’équipe Bravo du S.T.A.R.S. est envoyée dans les montagnes d’Arklay, mais le contact est perdu. Inquiète pour ses membres, l’équipe Alpha se rend également dans les montagnes et est rapidement attaquée par une meute de chiens. Ayant déjà perdu l’un de ses membres et le pilote de l’hélicoptère, l’équipe parvient de justesse à rejoindre un manoir voisin. Coupés de l’extérieur et sans possibilité d’appeler à l’aide, ce qui reste de l’équipe Alpha doit survivre aux horreurs qui les attendent dans ce manoir.