Missile Control est un jeu de type Missile Command. Le joueur doit défendre ses villes contre les bombardements entrants par des vaisseaux extraterrestres. Le joueur contrôle un curseur sur l’écran qui indique la direction du tir pour les missiles de défense. Une fois lancés, ils se déplacent en ligne droite à partir du lanceur à travers le point spécifié par le joueur jusqu’à ce qu’ils frappent un objet. Chaque niveau est gagné en détruisant tous les vaisseaux extraterrestres. Le joueur perd une fois que toutes ses villes sont détruites. Les villes bonus peuvent être obtenues en détruisant un nombre suffisant de vaisseaux extraterrestres. Le jeu devient de plus en plus difficile, par exemple, les bombes tomberont plus vite et les barrières d’énergie peuvent protéger les étrangers contre les attaques du joueur. Pour contourner les barrières, les joueurs peuvent détourner leurs tirs des gros missiles de défense lancés sur les côtés de l’écran.