Le Dr Egg man a découvert l’élément suralimenté ragnium sur la mythique île de Ragna Rock. Il l’exploite comme source de carburant, acheminant les sous-produits désordonnés de l’opération vers les îles adjacentes, créant un jeu de feu et de glace. Utiliser ce carburant pour alimenter ses robots de course ultra-rapides est son dernier plan pour discréditer son éternel rival Sonic, mais soutenu par le ragnium, le feu et la glace, une armée de robots et D-Fekt, un homme de main d’une puissance inflexible, cette fois le Dr Egg. l’homme peut réussir. Sonic et ses amis doivent revendiquer chaque île en détruisant les ennemis, en vainquant le Island Defender, en remportant des races rivales et en inversant le flux des tubes élémentaires. Tout se termine par une bataille épique sur l’île de Ragna Rock où Sonic devra peut-être sauver l’homme du Dr Egg de sa propre création.